Arda Turan'ın da formasını giydiği La Liga ekiplerinden Atletico Madrid, Emre'nin transferini kulübün internet sitesinden "Emre, kırmızı beyaz olacak" başlığıyla duyurdu. İspanyol ekip, tecrübeli futbolcunun Perşembe günü sağlık kontrolü için Madrid'e geleceğini ve ardından sözleşme imzalayacağını açıkladı. Atletico Madrid, Fenerbahçe ile sözleşmesi sona eren 32 yaşındaki futbolcuyu bonservis bedeli ödemeden transfer etmiş oldu.