Bu akşam Sivas ta oynanan maçta attığı muhteşem 2 golle Sivasspor'un direncini kırıp Galatasaray'ın 4-0 gibi farklı bir skorla galip gelmesini sağladı. Ligin 2 .yarısında geldiği Galatasaray da ardı ardına 6 gol attı.

 2003-04 sezonu'nun devre arasında Galatasaray'a transfer oldu.Galatasaray'da zaman uyum sorunu yaşamadan takım'da düzenli oynamaya başladı ve sezon sonuna kadar 14 müsabakada 9 gol kaydetti. Galatasaray'daki  ileriki üç sezonun'da takımın değışmez oyuncusu oldu ve a millî takım'dada düzenli olarak oynamaya başladı.2007-08 sezonun'da yeni teknik direktör Karl-Heinz Feldkamp ile büyük sorunlar yaşadı. 2008-09 sezonunda Feldkamp'ın takım'dan ayrılmasina rağmen özellikle Başkan yardımcısı Adnan Sezgin'in ısrarla Necati'yi istememesinden dolayı İspanya'nın Real Sociedad takımına kiralık olarak verildi.Necati'nin Galatasaray ile olan sözleşmesi, 2009 yılında karşılıklı fesh edildi.2008-2011 yıllarında Ankaraspor,İBB,Real Sociedad,Antalyaspor da oynayadı.

2011-2012 sezonun başında da birçok kulübün transfer listesine girdi fakat Kaptan Necati Antalyaspor'da kaldı. Ara transfer döneminin son 3 gününde yapılan pazarlıklar sonrası kulübü transfer döneminin son gününde Galatasaray ile anlaştı. Galatasaray ile anlaşan Necati Ateş ayrıca 30 golle Antalyaspor tarihinin en skorer oyuncusu oldu.